黑底白纹
斑马在胚胎发育的早期是纯黑色的，到了胚胎发育的晚期，黑色色素的生成被抑制，才出现了白色的条纹。另外，斑马白色条纹下面皮肤也是黑色的，这更进一步说明黑色才是斑马的本色。
人们通常把动物身上颜色面积占比较大的部分视为底色，可斑马身上的黑白纹面积基本是平均的，那么斑马的底色究竟是黑的还是白的呢？
关于这个问题的认识，还颇有一些曲折。中世纪时代，人们认为斑马是白底黑条纹；后来才认识到，斑马实质上是黑底白条纹。
一、白底黑条纹说
这个说法“强有力”的证据是：斑马肚皮下部是大片连续白色。这样，斑马整个身体看上去整体上白色占据主流地位，并且，白色似乎是连续的，因此，白色更像是本色。
而黑色看上去更像后来“画上去”的条纹，呈现给人白底黑条纹的感觉，就像黑色条纹投射在人体上。
而且，肚皮下部部位似乎是受保护区域，其白色也更应该是本色。
二、黑底白条纹说
但是，研究最终确认，斑马斑马实际上黑色背景上白色条纹的动物。
支持这个说法证据有两条：
第一，胚胎学上，斑马胚胎是完全黑色的，白色条纹是在胚胎最后阶段才出现 。因而，黑色是斑马真实或原始的颜色。
第二，斑马白色条纹下面皮肤也是黑色的，这更进一步说明黑色才是斑马的本色。
皮毛颜色是皮肤黑素细胞产生色素赋予的。
斑马黑底白条纹是由于色素选择性沉着的结果，斑马黑底白条纹是局部皮肤黑素细胞产生色素抑制，导致局部区域毛发很少或没有色素沉着的结果。
那斑马为什么选择条纹“衫”？
据说这种条纹“衫”是一种很好 的伪装色，成群的斑马聚聚在一起时，远远看上根本看不出斑马的样子，从而迷惑狮子和鬣狗等主要的捕食者。
另外，斑马条纹有助于调节体温。研究发现，具有最突出躯干条纹的斑马通常生活在北部。近赤道区域范围，而具有不太突出的躯干条纹的斑马更常见于南部，较冷的区域。
