全日制博士是非定向，在职博士是定向。全日制博士毕业后可以直接将干部报到证派遣到新单位。在职博士必须与原单位解约，才能去新单位。全日制博士在校期间享受奖学金，非全日制没有奖学金。全日制博士是有补助的，而在职博士学校是不会给补助的，一般是导师发点补助。
在职是相对全日制而言的，在职指的是原来有工作单位的人，在单位认可的情况下，一边工作一边读博。在职博士并不是另外一种博士，只是学习的形式不同。在职博士和全日制博士区别：
1、课学习时间不同
在职博士：利用非工作时间，是非全日制的学习，需要在职工作，所以其一般利用周末或工作之余进行学习。
全日制博士：是脱产全日制学习，其主要时间是在校学习。
2、毕业不同
在职博士：在职的是只有学位的。
全日制博士：脱产的博士学位学历都有。
3、入学方式不同
在职博士：在职的先免试入学，毕业之前要参加毕业的学位考试，发表论文等。
全日制博士：脱产的入学时候要考试的，毕业前发表论文。
