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主体不同。叛国罪的主体是那些知道国家机密的国家机关工作人员或国家工作人员；而间谍罪的主体是接受间谍组织或代理人的任务或为敌人提供情报的行为。即叛国罪在主观方面必须是故意的，而间谍罪在主观方面可能是无意的。
客体不同 。叛国罪的的客体是以自己的特殊身份而进行的危害国家安全和利益的行为；而间谍罪的客体是以间谍的形式，对他国进行离间破坏，或获取情报的一种行为。叛国罪更多的是直接破坏国家安全，而间谍罪则是间接的破坏国家安全。
定罪条件不同：叛国罪罪犯往往已经对社会造成了严重的危害或影响；而间谍罪罪犯只要实施了间谍行为，即可认定其犯罪了。有的国家将间谍罪包含在叛国罪里面，因此两者有一定的一致性。但是叛国罪包含的方面更广一些，情节更严重一些。
不管是叛国罪，还是间谍罪，两者都是影响国家安全的罪行，都应该受到人们的谴责。
